С 1967 года занимал инженерные и руководящие должности в Научно-исследовательском институте технологии и организации производства (НИАТ) и НИИ Экономики авиационной промышленности.
С 1983 до 1991 занимал должности инструктора Московского городского комитета КПСС, первого секретаря Сокольнического РК КПСС.
С 1991 по 1999 год занимал должности исполнительного директора Российского авиационного торгового дома и генерального директора российско-турецкой компании «ГЮРАКЛ».
С 1999 года работал начальником отдела префекта - руководителем аппарата Префектуры ЮАО г. Москвы.
С 2000 до 2010 год занимал должности начальника отдела магистрального транспорта, заместителя руководителя Департамента транспорта и связи города Москвы; входил в состав советов директоров ОАО «Московская кольцевая железная дорога» и ОАО «Центральная пригородная пассажирская компания», созданных с участием Правительства Москвы.
С 2010 по 2015 год занимал должность заместителя генерального директора ЗАО «Интегрированные транспортные системы», затем ООО «ИТС Консалтинг».
С декабря 2014 года избран и выполняет обязанности Президента Ассоциации «ЖЕЛДОРРАЗВИТИЕ».
Александр Борисович Кисько является членом Координационного совета по законотворческой деятельности Минтранса России, Комитета по пассажирским перевозкам Совета потребителей в сфере деятельности ОАО «РЖД», экспертом ряда созданных в отрасли рабочих групп.