Родился 16 мая 1938 года в Ленинграде (ныне Санкт-Петербург).
Во время войны жил в блокадном Ленинграде. Воспитывала Мстислава, его братьев и сестру Анну бабушка Анна Макаровна, так как их мать не успела вернуться с гастролей, когда город уже был в окружении. После войны семья переехала в Поволжье.
Первый выход на манеж состоялся в возрасте 5 лет в штанах (в зарядке) клоуна А. Дубино. В 1946 году в Саратове у Мстислава и Вальтера состоялся дебют на сцене, но в 1947 году во время гастролей по Дальнему Востоку их номер решили расформировать. Однако после выступления перед комиссией в Московском цирке номер братьев решили оставить.
Когда в 1949 году Вальтера призвали в Советскую Армию, одиннадцатилетний Мстислав последовал за братом и получил статус сына полка, после чего братья начали служить в ансамбле песни и пляски Одесского военного округа.
В 1954 году братья создали номер «Акробаты-вольтижёры», в котором выполняли уникальные трюки, которые не повторил пока[когда?] никто[источник не указан 668 дней]. За этот номер на VI Всемирном фестивале молодежи и студентов в Москве братьям вручили четыре золотые медали.
В 1964 году сделал новый номер «Акробаты-вольтижёры на лошадях», в котором акробаты-вольтижёры выполняли трюки на лошадях. Этот номер, по сути, создавший новый жанр в цирке, во время гастролей во Франции и Японии был удостоен высших мировых призов.[источник не указан 668 дней]
Окончил ГИТИС, режиссёрский факультет (1971).
В 1977 году создал единственный в мире[источник не указан 668 дней] спектакль, в котором слоны и тигры оказались в одной клетке. Аттракцион «Слоны и тигры» был удостоен Государственной премии Российской Федерации в области литературы и искусства в 1996 году.
В 1991 году поставил героико-исторический цирковой спектакль-пантомиму «Спартак», который по своему масштабу постановки не имеет[источник не указан 668 дней] аналогов в мире.
Также являлся режиссёром, постановщиком и исполнителем главных ролей в воздушно-феерическом аттракционе «К звёздам» (1970); в аттракционах: «Союз — Аполлон» (1974), «Шар смелости», «Воздушный полёт», «Канатоходцы»; в тематических цирковых спектаклях: «На арене — москвичи» (1965), «Русская зима» (1967—1968), «В космический век» (1970), «Весне навстречу» (1971), «Мы — артисты цирковые» (1976), «Ярмарка чудес» (1983), «С чего начинается Родина» (1987), «Наш русский цирк» (1997), в пантомимах: «Песнь докеров», «Маленький Пьер», «Отважные», а также в детских спектаклях: «Приключение Иванушки», «Ну, погоди», «Доктор Айболит», «Новые приключения Синдбада», «Новогодний карнавал», «Новогодний бал в цирке», «Капитан, капитан — улыбнитесь», «Приключения Мишутки».[источник не указан 668 дней]
С 1991 года был избран вице-президентом Всемирной ассоциации цирковых профессиональных школ и постоянным членом Комиссии при Президенте Российской Федерации по Государственным премиям в области литературы и искусства.
С 1992 по 2003 год, не прерывая артистической деятельности, занимал должность художественного руководителя и директора Сочинского государственного цирка. К 25-летию Сочинского цирка в 1996 году поставил две крупномасштабные программы: «Я люблю тебя, Россия» и цирковое супер-шоу «Звезды мирового цирка», которые на протяжении двух сезонов шли с успехом в Сочи и городах России. Эти два произведения циркового искусства стали основой для создания гала-представления — прощального артистического тура по Европе и Юго-Восточной Азии (Италия, Тайвань, Гонконг, Сингапур, Австралия). Прощальные гастроли прошли в Краснодаре, Ростове, Воронеже, Саратове, Казани, в столице — Москве, Санкт-Петербурге и Сочи.
С мая 2003 по декабрь 2009 года — генеральный директор Росгосцирка (в 1994—1996 годах — вице-президент). Причиной увольнения с поста генерального директора стали финансовые и юридические нарушения компании. Министр культуры А. Авдеев по этому поводу сказал, что М. Запашный на этом посту не справлялся со своими обязанностями.
Возглавлял жюри и организацию Первого Всемирного конкурса циркового искусства в 1996 году в Москве на Красной площади. Постоянный член жюри на всемирных конкурсах в Монте-Карло, Париже, Китае.
Скончался 22 сентября 2016 года в Сочи на 79-м году жизни. Похоронен в Москве на Перепечинском кладбище.