Равиль Гайнутдин родился 25 августа 1959 года в деревне Шали, Республика Татарстан. Экстерном с отличием окончил семилетний курс «Мир-и-Араб» медресе Бухары. По окончании учебы стал работать первым имамом-хатыбом Казанской мечети «Нур-Ислам».
Затем в 1985 году в Уфе Гайнутдин вступил в должность ответственного секретаря Духовного управления мусульман Европейской части СССР и Сибири. В 1987 году стал имам-хатыбом, а в 1988 первым имам-хатыбом Соборной мечети Москвы. В 1991 году вступил в должность президента Исламского центра Москвы и Московской области.
На учредительном меджлисе мусульманских религиозных объединений и общин Европейской части России в 1994 году Равиль Гайнутдин избран муфтием Духовного управления мусульман Центрально-Европейского региона. В 1996 году стал инициатором учреждения, а впоследствии председателем Совета муфтиев России.
В 2001 году Гайнутдин окончил Российскую академию государственной службы при Президенте Российской Федерации. В 2003 году там же защитил кандидатскую диссертацию на кафедре религиоведения на тему: «Ислам в России (опыт философского анализа)».
Равиль Исмагилович ведет активную научно-исследовательскую работу в области исламоведения. Участвует на научных и научно-богословских конференциях, международных конференций и форумов, где представляет мусульман Российской Федерации. Также автор многих посвященных разнообразным аспектам религии Ислам книг.
Равиль Гайнутдин является профессором Московского высшего духовного исламского колледжа. Академик Международной Академии наук Евразии, Международной Славянской Академии по науке, образованию, культуре и религии.
Равиль Исмагилович Гайнутдин входит в состав комиссии Общественной палаты по вопросам толерантности и свободы совести Совета по взаимодействию с религиозными объединениями при Президенте Российской Федерации.
Владимир Путин 4 июня 2018 года, встретился с председателем Совета муфтиев России Равилем Гайнутдином во время празднования Ураза-байрам. Во время беседы обсуждались организация духовной жизни мусульман и административно-хозяйственное устройство общин. Гайнутдин рассказал главе государства о развитии религиозного образования в стране.
В рамках VII отчетно-выборного съезда Духовного управления мусульман Российской Федерации 23 сентября 2019 года муфтий шейх Равиль Гайнутдин переизбран председателем организации. На съезде рассматривалась только одна кандидатура на пост председателя ДУМ РФ. Все участники съезда предложенную кандидатуру поддержали.
В Екатерининском зале Кремля 21 ноября 2019 года состоялась торжественная церемония вручения государственных наград России. За большой вклад в укрепление межнационального и межконфессионального мира и согласия в обществе Президент России Владимир Путин наградил Равиля Исмагиловича Гайнутдина Орденом «За заслуги перед Отечеством» II степени.