Елена Афанасьева родилась 27 марта 1975 года в городе Оренбург. После школы поступила в Оренбургский государственный педагогический университет, который окончила в 1997 году. Учась в университете, принимала участие в организации Оренбургского регионального отделения «Либерально-демократической партии России». В 1998 году Елену Владимировну избрали руководителем Оренбургского регионального отделения партии «ЛДПР».
Второе высшее образование Афанасьева получила в Дипломатической академии Министерства иностранных дел России, став специалистом в области международных отношений. Позднее, стала выпускником Института мировых цивилизаций по специальности «юрист». Защитив диссертацию в Институте международного права и экономики имени Грибоедова, получила ученую степень «кандидат исторических наук».
В 2003 году Елена Афанасьева избрана депутатом Государственной думы России IV созыва по федеральному списку «ЛДПР». В Думе сначала являлась членом комитета по экономической политике, предпринимательству и туризму, затем стала членом комитета по экологии. В том же году, перешла в комитет по делам женщин, семьи и молодежи.
В октябре 2005 года Елена Владимировна назначена министром образования Калининградской области. Однако через несколько дней ушла с занимаемой должности.
С 2006 года исполняла обязанности заместителя Председателя фракции «ЛДПР».
Елена Владимировна в декабре 2007 года избрана депутатом Государственной думы V созыва, и до 2010 года являлась членом Высшего Совета партии «ЛДПР», также занимала должность председателя Центральной контрольно-ревизионной комиссии партии «ЛДПР».
Афанасьева Елена Владимировна 4 декабря 2011 года избрана депутатом Государственной Думы VI созыва по партийному списку «ЛДПР». Член комитета Государственной Думы Российской Федерации по вопросам семьи, женщин и детей.
В декабре 2012 года Елена Владимировна вместе с депутатом от партии «Единая Россия» Екатериной Лаховой стала инициатором поправок в законопроект, рассматриваемый Государственной Думой в ответ на принятие в Соединенных Штатах Америки закона Магнитского, которые вводят запрет на усыновление российских детей-сирот американскими гражданами и прекращающей действие соответствующего Соглашения с США.
В 2013 году 12 декабря вместе с другим депутатом от «ЛДПР» Яном Зелинским внесла на рассмотрение Государственной думой проект Федерального закона «О внесении изменения в статью 1 Федерального закона «О Государственном языке Российской Федерации».
Правительством Оренбургской области Елена Афанасьева делегирована в Совет Федерации. Наделена полномочиями с 26 сентября 2014 года.
Указом, подписанным Денисом Паслером 18 сентября 2019 года, Елена Афанасьева вновь наделена полномочиями представлять правительство Оренбургской области в Совете Федерации Федерального Собрания Российской Федерации.
Воспитывает сына и дочь.