Мария Агранович родилась 14 февраля 1989 года в городе Москва. Девочка росла в творческой семье кинооператора и режиссера Михаила Аграновича и сценариста документального кино Аллы Агранович. С самого детства связана с миром кино.
С тринадцати лет Мария работала на съемочной площадке - сначала «хлопушкой», а затем и вторым режиссером. В 2010 году окончила режиссерский факультет Всероссийского государственного института кинематографии имени С. А. Герасимова. Училась в мастерской Владимира Ивановича Хотиненко.
Еще во время учебы Агранович начала снимать короткометражные фильмы, где выступала не только в качестве режиссера, но и являлась сценаристом и актрисой. На ее счету такие фильмы как «Упражнение №1», «В лифте», «Жду тебя».
За фильм «No problem» Мария Агранович получила приз Высших курсов сценаристов и режиссеров за лучший режиссерский дебют на ОФ кино стран СНГ, Латвии, Литвы и Эстонии «Киношок». Также удостоилась приза за лучший игровой фильм на Московском кинофестивале короткометражных фильмов.
Драматический триллер «Люби их всех» Марии Агранович стал участником конкурсной программы «Кинотавр-2019». Премьера этого фильма состоится 3 октября 2019 года.