Андрей Вагнер родился 17 августа 1957 г.
После окончания Красноярского политехнического института работал на Западно-Сибирской ТЭЦ, где прошел путь от машиниста центрального пульта управления турбинами до директора станции.
С 1998 по 2000 год работал исполнительным директором, первым заместителем генерального директора ОАО «Кузбассэнерго».
Андрей Вагнер также возглавлял Департамент электрических станций РАО «ЕЭС России», а затем занимал пост заместителя управляющего директора Бизнес-единицы N 2 РАО «ЕЭС России». С 2006 года руководил ОАО «ТГК-2».
C 2009 года занимал должность первого заместителя генерального директора ПАО «Т Плюс».
С сентября 2016 года занимал должность исполняющего обязанности генерального директора ПАО «Т Плюс».
С декабря 2016 года по март 2017 года занимал должность Президента ПАО «Т Плюс».
С марта 2017 года утвержден Первым заместителем генерального директора ПАО «Т Плюс».
С марта 2019 года утвержден и.о. генерального директора ПАО «Т Плюс».