Сергей Аноприенко родился 24 ноября 1970 года в городе Новый Оскол, Белгородская область. Окончил Московское высшее общевойсковое командное училище имени Верховного Совета Российской Федерации. Позднее, получил дополнительное образование в Российской академии народного хозяйства и государственной службы при Президенте Российской Федерации.
Непосредственно по окончании военного ВУЗа, Аноприенко продолжил службу. Вплоть до 2012 года, служил в МЧС Российской Федерации.
Далее, поступил на государственную гражданскую службу в Федеральное агентство по управлению государственным имуществом.
Начиная с 2016 года, опытный управленец занимал должность начальника Управления имущества федеральных органов власти и организаций в сфере обороны и безопасности Федерального агентства по управлению государственным имуществом.
Затем, в соответствии с Распоряжением Председателя Правительства Российской Федерации от 20 октября 2017 года и Приказом Министерства экономического развития Российской Федерации от 26 октября того же года, назначен заместителем руководителя Федерального агентства по управлению государственным имуществом.
В сентябре 2019 года, Аноприенко Сергей Михайлович назначен на должность замминистра природных ресурсов и экологии - руководителем Федерального агентства лесного хозяйства.
Имеет чин Действительного государственного советника РФ 3 класса.