В 1991 г. Вероника Никишина окончила Московский химико-технологический институт им. Д.И. Менделеева. Кандидат экономических наук, защитила диссертацию по теме «Управление доступом российских товаров на рынки зарубежных государств в современных условиях».
В системе внешнеэкономических связей работает с 1999 года.
В 1999-2014 годах работала на разных должностях в Министерстве экономического развития Российской Федерации, возглавляла Департамент стран Америки и Департамент координации, развития и регулирования внешнеэкономической деятельности, являлась заместителем главы российской переговорной делегации по присоединению России к ВТО.
С января 2015 г. по январь 2016 г. занимала должность помощника Первого заместителя Председателя Правительства Российской Федерации.
С 1 февраля 2016 года — член Коллегии (Министр) по торговле Евразийской экономической комиссии.
С 31 января 2020 года — Генеральный директор, АО «Российский экспортный центр»