Родилась 25 марта 1982 года в Саратове. Окончила Российскую академию государственной службы по специальности «Юриспруденция». Получила дополнительное образование в Российском экономическом университете им. Плеханова по специальности «Финансы и Кредит». В 2021 году окончила Бизнес-школу IMD по корпоративной программе Executive MBA.
С 2011 по 2016 годы возглавляла дирекцию по корпоративным и имущественным отношениям в компании «ЕвразХолдинг».
В 2016 году присоединилась к X5 Group. К 2020 году сформировала и внедрила коллегиальную модель управления компанией, провела реструктуризацию структуры группы и её активов, руководила проектами по автоматизации ряда процессов.
С 2018 года руководит Согласительной комиссией по работе с поставщиками, созданной внутри Х5 Group.
В марте 2022 была назначена на должность Президента X5 Group.[1] Под руководством Екатерины Лобачевой X5 Group ускорила развитие магазинов «Чижик» формата «жесткий дискаунтер» и вышла в Уральский регион. В августе 2022 года Екатерина Лобачева курировала открытие распределительного центра и первых магазинов «Чижик» в Свердловской области. Церемония открытия прошла совместно с губернатором Свердловской области Евгением Куйвашевым, который отметил вклад руководства X5 Group в развитие торговых сетей в регионе.
В сентябре 2022 года в рамках Восточного экономического форума Екатерина Лобачева утвердила намерения X5 Group об инвестициях 10 млрд рублей в развитие торговых сетей на Дальнем Востоке. Президент подписала соглашение с Корпорацией развития Дальнего Востока и Арктики при участии Заместителя Председателя Правительства РФ — полномочного представителя Президента РФ в ДФО Юрия Трутнева и Министра РФ по развитию Дальнего Востока и Арктики Алексея Чекункова. Документ позволит открыть магазины в четырёх регионах: в Приморском, Хабаровском и Забайкальском крае, а также Амурской области.