Екатерина Мцитуридзе родилась 10 января 1972 года в городе Тбилиси, Грузия. После школы, в 1994 году окончила исторический и киноведческий факультеты Тбилисского государственного университета имени Джавахишвили. Диплом, который защищала на историческом факультете, посвящен итальянским миссионерам XVII века, а на киноведческом, творчеству Отара Иоселиани.
За дипломную работу на историческом факультете Екатерина оказалась удостоена степени магистра исторических наук. В активе Мцитуридзе также имеются дипломы Каннского и Венецианского кинофестивалей, AFM в Лос-Анджелесе.
До 1994 года работала в Грузии: в журнале «Синема», газете «Новинки экрана» и на втором канале грузинского телевидения. В 1995 году стала помощницей президента XIX Московского Международного Кинофестиваля кинорежиссера Сергея Соловьева. С 1996 года вела авторскую рубрику о кино в утренней программе Первого канала.
В июне 2001 года Мцитуридзе являлась членом жюри FIPRESCI 23 Московского Международного кинофестиваля. В мае 2002 года также вошла в жюри FIPRESCI 55 Каннского Международного кинофестиваля. Через год Екатерину пригласили в жюри дебютных фильмов 25 ММКФ. В мае 2008 года выступала членом жюри «Особый взгляд» 61 Каннского международного кинофестиваля.
В том же месяце Мцитуридзе стала учредителем и директором Российского Павильона на Каннском международном кинофестивале. С сентября 2010 по январь 2011 года вела североамериканскую PR и рекламную кампании фильма «Край», режиссера Алексея Учителя. Фильм получил номинацию на премию Иностранной прессы Голливуда HFPA: «Золотой глобус». Параллельно заключила договор с крупнейшим интернет порталом США: HULU о дистрибуции 12 новых российских фильмов и телесериалов канала СТС.
Мцитуридзе является членом Союза кинематографистов России, Союза журналистов России и Международного союза журналистов, член Ассоциации международной кинопрессы ФИПРЕССИ, академик Национальной Академии кинематографических искусств и наук России.
С 26 апреля 2011 по 6 февраля 2020 года занимала должность генерального директора открытого акционерного общества «Роскино».