Давид Якобашвили родился в Тбилиси, Грузинская ССР. Его дед, сапожник из бедной еврейской семьи, по воле судьбы оказался в Китае, откуда привез кожу для пошива обуви. Во время Первой мировой войны стал поставщиком двора Его Императорского Величества и поставлял сапоги для русской армии. Отец Давида Якобашвили служил механиком на морском судне, его семья пережила Ленинградскую блокаду. Семья по материнской линии всю жизнь прожила в Москве.
Давид Якобашвили учился в физ-мат школе и школе с биологическим уклоном. Мечтал о карьере дипломата. Но, отказавшись от этой идеи, по окончании школы поступил в Тбилисский Политехнический институт по специальности «Промышленное и гражданское строительство». Чтобы содержать семью, бросил учёбу. Работал по ночам в Метрострое чернорабочим, днём — в лаборатории Металлургического института. Впоследствии занимался звукозаписью и ремонтом аудиотехники. Научившись ремонтировать радио- и аудиотехнику, брал частные заказы. Работал во вневедомственной охране (устанавливал сигнализации в домах). В 1982 году сотрудникам МВД разрешили взять на выращивание поросят, чтобы потом, возвратив их государству, получить деньги за разницу в весе. Якобашвили принял участие в этой программе: взял 200 поросят на год, отвёз их за город к приятелю, с которым построили небольшую ферму. Через год Якобашвили получил доход.
Компания «Вимм-Билль-Данн» (ВБД) была создана в 1992 году Сергеем Пластининым и Михаилом Дубининым. Бизнес начался с линии по разливу соков, взятой в аренду, и кредита в $50 тыс. Пластинин и Дубинин пригласили Давида Якобашвили. Вместе с другими партнёрами они арендовал линию по розливу соков на Лианозовском молочном комбинате. Основатели компании в 1994 году придумали бренд «J7» (англ. Seven Juices), а через год ВБД выкупил акции Лианозовского комбината и стали производить молочную продукцию.
В 2011 году «Вимм-Биль-Данн» была приобретена корпорацией PepsiCo за $5,7 млрд. Это стало крупнейшей сделкой PepsiCo за пределами Северной Америки и крупнейшей зарубежной инвестицией в несырьевой рынок России. По оценкам СМИ, Давид Якобашвили выручил от продажи 10 % ВБД около $600 млн. «Все получили огромную премию. Все инвесторы, кто инвестировал в нашу компанию, все были довольны. До сих пор меня встречают и говорят, что это одна из самых удачных сделок, которая когда-либо была», — делился в интервью Якобашвили в 2014 году.