Сергей Когорин родился 16 ноября 1957 года в селе Большие Ключи, Республика Татарстан. После школы и технического училища сразу начал работать фрезеровщиком на Казанском моторостроительном заводе. В 1977 году окончил Казанский авиационный техникум и поступил в физический факультет Казанского государственного университета, где в 1982 году получил специальность «Радиофизика и электроника».
В этот период годах работал инженером - настройщиком на предприятии «Эра». Затем, с 1985 года на протяжении пяти лет являлся старшим инженером, начальником бюро, заместителем главного механика и председателем профкома Зеленодольского машиностроительного завода. В эти годы, обучаясь без отрыва от работы, окончил Банковскую школу.
В 1990 году Сергей Когогин возглавил Зеленодольский машиностроительный завод, а через четыре года назначен Главой администрации Зеленодольского района. Затем занял должность заместителя премьер-министра, министра экономики и промышленности Республики Татарстан.
С июня 1999 года стал членом Совета директоров ПАО «КАМАЗ», а с 26 апреля 2002 года назначен генеральным директором OAO «КАМАЗ». Под его руководством компания совершила уникальный рывок и заняла достойное место среди производителей грузовой техники не только на территории СНГ, но и в мире. На пути создания нового облика «КАМАЗа» как современного, ориентированного на клиента предприятия Сергею Анатольевичу пригодился его опыт работы на промышленных предприятиях и в органах власти.
Генеральный директор не только осуществляет макроэкономическое руководство, но и лично контролирует производственный процесс, новые конструкторские разработки, заключает выгодные контракты, решает законотворческие проблемы, защищая интересы всех российских автопроизводителей. Под его руководством решена проблема реструктуризации долгов ПАО «КАМАЗ», по его инициативе постоянно обновляется модельный ряд автомобилей КАМАЗ и осваиваются новые современные конкурентоспособные модели.
При Когогине Публичное Акционерное Общество «КАМАЗ», сохраняя лучшие корпоративные традиции, стала компанией, вносящей реальный вклад в развитие культурных и духовных ценностей. Примером этого является материальная поддержка строительства храма Христа Спасителя в Москве, мечети Кол Шариф в Казанском Кремле.
Являясь градообразующим предприятием, ПАО «КАМАЗ», под руководством Сергея Анатольевича вносит весомый вклад в развитие социальной сферы Набережных Челнов, оказывая всестороннюю поддержку многочисленным творческим коллективам и организациям культуры города. Это камерный оркестр «Провинция», картинная галерея.
Также ведет государственную и общественную деятельность. Являлся депутатом Государственного совета Республики Татарстан. С января 2006 года возглавляет некоммерческое партнерство «Объединение автопроизводителей России» в качестве председателя его совета.
Генеральный директор ПАО «КамАЗ» Сергей Когогин и глава госкорпорации «Ростех» Сергей Чемезов 13 декабря 2019 года провели встречу с Президентом России Владимиром Путиным. Стороны обсудили разработки в области беспилотного транспорта, производство электробусов, а также вопросы финансирования, для расширения производственных мощностей автоконцерна и открытия филиала Казанского государственного университета в городе.
Сергей Анатольевич Когогин имеет ученую степень кандидата экономических наук. По его инициативе ведутся работы по возрождению исторических памятников: Раифского монастыря и древнего остров-града Свияжска.