Родился 7 февраля 1978 года в Москве. Отец — М. Е. Фрадков, бывший директор Службы внешней разведки Российской Федерации, экс- Председатель Правительства Российской Федерации.
Кандидат экономических наук с 2006 года, тема диссертации — «Стратегические направления интеграции экономики России в мировое хозяйство».
В 2000—2004 гг. — эксперт 1 категории, заместитель Представителя Внешэкономбанка в Соединенных Штатах Америки, начальник отдела Внешэкономбанка СССР. В 2004—2005 гг. — заместитель генерального директора ОАО «Дальневосточное морское пароходство».
В 2005—2007 гг. — заместитель директора дирекции — директор департамента, Первый заместитель директора дирекции Внешэкономбанка СССР (с 08.06.2007 г. — государственная корпорация «Банк развития и внешнеэкономической деятельности (Внешэкономбанк)»). С января 2006 года работает директором департамента структурного финансирования «ВЭБа», также занимает должность председателя правления и генерального директора ОА «Эксар».
С февраля 2006 года — заместитель директора дирекции Внешэкономбанка.
С июня 2007 года — член Правления — заместитель Председателя Государственной корпорации «Банк развития и внешнеэкономической деятельности (Внешэкономбанк)».
В 2007 году вошёл в совет директоров дочерней компании «Аэрофлота» — ОАО «Терминал», созданной для строительства третьего терминала аэропорта «Шереметьево».
С 2011 года — директор ОАО «Российское агентство по страхованию экспортных кредитов и инвестиций».
В январе 2015 назначен первым заместителем Председателя — членом Правления Внешэкономбанка.
В 2015 году занимает должность генерального директора АО «Российский экспортный центр» по совместительству.
В июне 2016 покинул правление ВЭБа, оставшись генеральным директором АО «Российский экспортный центр».
В январе 2018 года было объявлено, что Пётр Фрадков возглавит обновлённый Промсвязьбанк, основной специализацией которого является проведение операций по гособоронзаказу и крупным госконтрактам.
24 апреля 2018 года Фрадков был назначен руководителем временной администрации Промсвязьбанка.
Является профессором кафедры международного бизнеса факультета мировой экономики и мировой политики Национального исследовательского университета «Высшая школа экономики».
Окончил Московский государственный институт международных отношений по специальности «мировая экономика» (2000 год), бизнес-школу Кингстонского университета (Лондон, 2007 год), Академию народного хозяйства при Правительстве Российской Федерации (2007 год). В 2007 г. окончил Кингстонскую бизнес-школу Кингстонского университета по специальности «Мастер делового администрирования», Академию народного хозяйства при Правительстве Российской Федерации по специальности «Мастер делового администрирования». Кандидат экономических наук.